sábado, 24 de julio de 2021

ADN recombinante natural y artificial

ADN recombinante natural

Existen tres mecanismos de recombinación génica en bacterias: conjugación, transformación y transducción. Si nos referimos a la conjugación, consiste en que se realiza contacto físico entre una célula donante y una célula receptora mediante transferencia de un plásmido. Los plásmidos en este caso, actúan como vectores de ADN, y su importancia radica en dan a la bacteria resistencia a los antibióticos porque son los portadores de genes. (1)


ADN recombinante artificial de la SORDERA

El síndrome de Laron ocurre por variaciones de la GH y entre sus factores de riesgo está la otitis recurrente con propensión a sufrir sordera. Para el tratamiento, se emplea la Mecasermina, que es un factor de crecimiento tipo 1 humano (IFG-1), producido por tecnología ADN recombinante, cumple la función de mediador de crecimiento a nivel hormonal y produce efectos metabólicos para el crecimiento tisular y óseo. (2)

T: Influencia de la Mecasermina como tratamiento en pacientes con Síndrome de Laron en Ecuador
O: Determinar y especificar la influencia del fármaco Mecasermina como tratamiento en pacientes con Síndrome de Laron
G: En base a secuencia de polipéptidos, se clonó en pET15b.
ER: NcoI y BamHI
EL: T4-ADN ligasa
V: Vector de Expresión pET15b y Vector Recombinante puc57
CR: Procariota Escherichia coli
MTG: Transformación por conjugación bacteriana
MIC: Método de cultivo, Western blot, Electroforesis en gel de agarosa (3)

Referencias bibliográficas

1. Wally N, Schneider M, Thannesberger J, Kastner MT, et al. Plasmid DNA contaminant in molecular reagents. Scientific Reports [Internet]. 2019 Feb 7 [citado 2021 Ago 4];9(1). Disponible en: https://www.nature.com/articles/s41598-019-38733-1

2. Guevara Luna MS & Roche Triviño JM. Influencia de la mecasermina como tratamiento en pacientes con síndrome de Laron en Ecuador. Ugeduec [Internet]. 2021 [cited 2021 Jul 24]. Disponible en: http://repositorio.ug.edu.ec/handle/redug/53784

3. Jafari S, Babaeipour V, Seyedi H, et al. Recombinant production of mecasermin in E. coli expression system. Research in pharmaceutical sciences [Internet]. 2014 [citado 2021 Jul 29];9(6):453–61. Disponible en: https://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC4326983/

viernes, 16 de julio de 2021

Técnicas moleculares de secuenciación de Ascariasis

Para la secuenciación de muestras de Ascaris lumbricoides se desarrolló un método de extracción de ADN modificado, basándose en los métodos de Fenol/Cloroformo y Qiagen. Para las cinco muestras de la línea germinal basados ​​en cox-1, el ADN debía extraerse del útero, el oviducto o también del ovario del helminto. Luego se secuenciaron estas muestras de ADN del A. lumbricoides utilizando la secuenciación de extremos emparejados de lectura corta de Illumina HiSeq 2500. El ADN se cuantificó mediante UV Spec y Picogreen. La secuenciación se realizó para obtener una profundidad genómica mínima de cobertura 20X para cada muestra. (1)


Referencias bibliográficas
1. 
Easton A, Shenghan Gao, Lawton SP, Sasisekhar B, Asis K, Dahlstrom E, et al. Molecular evidence of hybridization between pig and human Ascaris indicates an interbred species complex infecting humans [Internet]. eLife. eLife Sciences Publications, Ltd; 2020 [citado 2021 Jul 16]. Disponible en: https://elifesciences.org/articles/61562#sa2

viernes, 9 de julio de 2021

Prueba PCR para la Ascariasis

Tema: PCR cuantitativa (qPCR) y PCR digital (dPCR) para la detección de huevos de Ascaris lumbricoides en agua recuperada
Objetivo: Detectar la cantidad de huevos de A. lumbricoides en agua recuperada mediante el uso de qPCR y dPCR para determinar si es factible la reutilización del agua y evitar los riesgos de infección humana
Muestra: Agua dulce, suelo y aguas residuales
Ácido Nucleico a ser extraído: ADN genómico bacteriano
Gen o Secuencia a amplificar: Los cebadores específicos fueron Alum96F y Alum183R, que amplificaron el fragmento de 89 pb de la secuencia de ITS-1
PCR: 
qPCR (PCR cuantitativa)
95°C - 10 minutos
95°C - 10 segundos         (40 ciclos)
60°C - 40 segundos

dPCR (PCR digital)
95°C - 10 minutos
60°C - 2 minutos           (40 ciclos)
98°C - 30 segundos
72°C - 2 minutos
Sensibilidad y Especificidad Analítica:
Visualización: Electroforesis

Referencias bibliográficas
1. Acosta L, Trinidad AB, Bornay FJ, et al. Quantitative PCR and Digital PCR for Detection of Ascaris lumbricoides Eggs in Reclaimed Water. BioMed Research International [Internet]. 2017 [citado 2021 Jul 9];2017:1–9. Disponible en: https://doi.org/10.1155/2017/7515409

viernes, 2 de julio de 2021

Alteraciones de la Epigenómica en la Ascariasis

El aumento de la acetilación de histonas en el ADN en genes de clave tipo 2 se han asociado con un aumento de los niveles de IgE frente a los alérgenos de Ascaris lumbricoides. La exposición a estos alérgenos producidos por el helminto (ABA-1), induce cambios epigenéticos en las células inmunitarias que afectan el inicio y mantenimiento de los fenotipos inmunitarios. En el estudio se detectó una asociación entre los niveles de acetilación H3 y H4 en el LIG4/ABHD13 en el locus 13q33 con la carga total de huevos de Ascaris. Se cree que papel de la IgE en la inmunidad protectora es que la IgE puede desempeñar un papel importante en la reducción de la carga de huevos durante la ascariasis. También determina el papel de la acetilación de H4 en la expresión de CHI3L1 revela que se modifica al entrar en contacto con las larvas de Ascaris. (1)


Referencias bibliográficas

1. Zakzuk J, Acevedo N, Harb H, et al. IgE Levels to Ascaris and House Dust Mite Allergens Are Associated With Increased Histone Acetylation at Key Type-2 Immune Genes. Frontiers in Immunology [Internet]. 2020 Apr 28 [citado 2021 Jul 2];11. Disponible en: https://doi.org/10.3389/fimmu.2020.00756

viernes, 25 de junio de 2021

Alteración de la Traducción de la ascariasis

El helminto Ascaris lumbricoides induce a la formación de los llamados: granulomas. Los granulomas se producen en los tejidos y en los pulmones junto con los macrófagos, neutrófilos y eosinófilos. Y van a presentar unas proteínas granulares que son muy tóxicas para los helmintos que son: la proteína básica mayor tipo 1 (MBP1) y la proteína básica (MBP2). Estas proteínas van a actuar durante la interrupción de la membrana celular y la actividad enzimática. Las proteínas catiónicas provocarán una exfoliación y una lesión de las células epiteliales. (1) (2)


Referencias bibliográficas
1. Fonte Luis, Baldriche J, Sarracent J, Hernández Y & Fong A. Regulación por helmintos de las respuestas inmunitarias del hospedero. Rev Cubana de Medicina Tropical [Internet]. 2016 [citado 2021 Jun 25];68(1). Disponible en: http://scielo.sld.cu/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0375-07602016000100001
2. Zakzuk J. Inmunorregulación inducida por helmintos: una actualización. Scielo [Internet]. 2016 [cited 2021 Jun 25];29(2). Disponible en: http://www.scielo.org.co/scielo.php?script=sci_arttext&pid=S0121-07932016000200007

jueves, 17 de junio de 2021

Alteraciones de la transcripción de la ascariasis

La transcripción es el proceso en el que se copia la secuencia de ADN de un gen para formar una molécula de ARN. El helminto Ascaris lumbricoides produce y secreta una cistatina (inhibidora de cisteína proteasa recombinante de Ascaris o Al CPI) y actúa sobre los factores de transcripción NFkB (proteínas que controlan las respuestas inflamatorias) y TNF-α (proteínas que intervienen en la inflamación y apoptosis) inhibiendo su unión al ADN. Al inhibir esta unión, también se bloquean dos proteínas NFkB: ReIA, que es necesaria para secretar moléculas de adhesión que media el reclutamiento de neutrófilos y p50, que limita su expresión.(1,2)


Referencias bibliográficas

1. Coronado S. Estudios experimentales sobre el efecto inmunomodulador de la cistatina de Ascaris lumbricoides [Internet]. 2021 [citado 2021 Jun 17]. Disponible en: https://repositorio.unicartagena.edu.co/bitstream/handle/11227/11221/Tesis%20SANDRA%20MILENA%20CORONADO%20RIOS.pdf?sequence=1&isAllowed=y

2. Prince BT, Devonshire AL, et al. Regulatory T-cell populations in children are affected by age and food allergy diagnosis. Journal of Allergy and Clinical Immunology [Internet]. 2017 [citado 2021 Jun 17];140(4):1194-1196.e16. Disponible en: https://www.jacionline.org/article/S0091-6749(17)30840-0/pdf